2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。莱昂纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普奥尼尔成功接头，并和忍者神龟莱昂纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳泰罗汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”，忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。
日野聪 原由实 加藤将之 青山吉能 生天目仁美 早见沙织 户松遥
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Andrew S. Bates Bob Carter Lacey Patten
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小野友树 高桥广树 鸟海浩辅 羽多野涉 佐藤拓也 内田雄马 速水奖 落合福嗣
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高桥广树 岸祐二 折笠富美子 安元洋贵 泽城美雪 福圆美里 园崎未惠 大塚明夫 武虎 诹访部顺一 大木民夫 高桥研二 千千和龙策 玄田哲章 纳谷六朗 凯尔·赫伯特 鲁本·兰登 劳拉·贝莉 特拉维斯·威林厄姆 凯特林·格拉斯 布里特妮·李·哈维 米歇尔·拉夫 迈克尔·麦康诺希 戴夫·麦罗
Bret 'Brook' Parker 巴德·乐凯 Eli Fucile 杰森·李
未知
演员：日野聪 原由实 加藤将之 青山吉能 生天目仁美 早见沙织 户松遥
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